Ближе к концу фильма Коул и Кэтрин смотрят фильм «Головокружение» – фильм Альфреда Хичкока, который вдохновлял Криса Маркера при съемках «Взлетной полосы».

Гиллиам дал Уиллису список типичных актерских клише, от которых он должен отказаться при съемках «12 обезьян», включая «стальной голубоглазый взгляд».

Сцены в психушке были сняты в Eastern State Penitentiary, закрытой тюрьме штата Пенсильвания.

По радио мы слышим фразу «Это отчет Роджера Прэтта». Роджер Прэтт – оператор фильма.

Брэд Питт, сыгравший безумца Гойнса, согласился сняться за сравнительно небольшой гонорар; на момент начала съемок он еще находился в статусе восходящей звезды. Однако затем успели выстрелить «Интервью с вампиром» (1994), «Легенды осени» (1994) и «Семь» (1995), после чего актер получил статус высокооплачиваемой звезды.

Джеффри Гойнс говорит быстро и невнятно; Гиллиам думал, что Питт не сумеет освоить для этой роли быструю «скороговорку». Для начала он отправил его к репетитору, а затем просто заставил перестать курить – и добился нужного эффекта.

Коул произносит: «Я вижу мертвецов». Спустя четыре года эта фраза будет преследовать Уиллиса в мистическом триллере «Шестое чувство» (1999) (ее произносит мальчик по имени Коул).

Джефф Бриджес претендовал на роль Джефри Гоинса.

Ник Нолти претендовал на роль Джеймса Коула.

Съёмки проходили с 8 февраля по 6 мая 1995 года в Филадельфии и Балтиморе.

Во время съёмок не раз возникали сложности из-за погодных условий зимой и сложных механизмов, использованных для создания атмосферы будущего.

В связи с тем, что фильм имеет нелинейный сюжет, не раз допускались ошибки и некоторые сцены пришлось переснимать. Несмотря на возникшие в ходе съёмок сложности, режиссёру удалось не выйти за рамки бюджета, съемки продлились лишь на одну неделю больше.

Художник-постановщик Джеффри Бикрофт признался в том, что снимать этот фильм было тяжело и дело было не в недостатке денег или времени, а в режиссёре Гиллиаме, который изо всех сил пытался не выйти за рамки бюджета, так как ранее получал за это нагоняи.

Так как создатели фильма не имели возможности снимать в павильонах, они нашли заброшенные здания, памятники архитектуры, в которых съёмка была разрешена. Финальная сцена снималась в Балтиморском аэропорту и Пенсильванском торговом центре.

Действие фильма разворачивается в 1917, 1990, 1996 и 2035 гг.

Многие актёры согласились играть за меньший, чем обычно, гонорар, лишь бы сняться у Терри Гиллиама.

Слоганом фильма изначально предложили фразу «Дни грядущего в руках человека, их лишённого», однако затем решение изменили, т.е. фраза звучала так, будто речь идёт о человеке, лишённом рук, а не будущего.

За исполнение роли Джеффри Гоинса актёр Брэд Питт получил свой первый «Золотой глобус» и номинацию на «Оскар».

Американский архитектор-теоретик и художник Леббеус Вудс (1940-2012) утверждал, что кресло для допросов, показанное в фильме, весьма напоминает его работу 1987 года. После выхода фильма на экраны Вудс сумел даже добиться судебного запрета на прокат. В конце концов, все свои возражения он снял, но только после того, как компания Universal выплатила ему шестизначную сумму.

На создание подпольной «Армия 12 обезьян» авторов сценария вдохновил эпизод из детской книги «Волшебство страны Оз» (1919) Лаймена Фрэнка Баума (1856-1919), в которой персонажи уговаривают 12 обезьян стать солдатами в обмен на неограниченное количество еды.

Показанные в фильме репортёры в передаче новостей действительно в момент съёмок были репортёрами и работали в новостной редакции.

Терри Гиллиам рассказывал, что Джозеф Мелито, сыгравший Коула в детстве, его разочаровал. Мальчика взяли на роль потому, что у него были выразительные глаза, но Гиллиам считал, что на роль он всё равно не подходит. На съёмочной площадке даже присутствовал другой юный актёр, на случай, если Мелито не будет даваться какая-либо сцена.

Когда Кэтрин Рэйли впервые сообщают о Коуле, она присутствует на вечере поэзии, и в этот момент читают рубаи Омара Хайяма (1048-1131).

В кинотеатре, где без остановки показывают фильмы Хичкока, Кэтрин надевает парик и преображается в блондинку. Известно, что Альфред Хичкок (1899-1980) имел слабость к актрисам-блондинкам. В этот момент звучит музыка из кульминационной сцены фильма «Головокружение» (1958). В этой сцене тоже есть брюнетка, которая преображается в блондинку.

Кэтрин впервые появляется в фильме во время лекции, которую она читает в художественном музее Уолтерс – это публичный художественный музей в пригороде Балтимора.

Главную роль в фильме предлагали Роберту Де Ниро, но он предложение отклонил.

Фильм начинается и заканчивается крупным планом глаза молодого Коула.

В одном из кадров можно заметить на стене постер дебютного альбома рэпера Nas'а, выпущенного в 1994 году.

Терри Гиллиам умышленно сделал сюжетную линию двойственной. В фильме есть множество намёков на то, что Коул просто безумен, и что ничего из показанного о будущем в действительности не происходит. Именно поэтому режиссёр хотел закончить фильм сразу после смерти Коула, чтобы юный Коул смотрел на доктора Рэйли. Однако ещё сняли сцену, в которой женщина-учёный из будущего в самолёте забирает у доктора Питерса образец вируса и таким образом выполняет порученное Коулу задание, а также сцену с юным Коулом возле аэропорта. Гиллиам хотел дать фильму одну из этих двух концовок, но в итоге использовал обе.

Режиссёр Терри Гиллиам и продюсер Чарльз Ровен неоднократно спорили о том, как фильм должен закончиться. Гиллиам хотел закончить его кадром, в котором Рэйли смотрит на юного Коула, тогда как Ровен предпочитал прописанную в сценарии сцену на парковке возле аэропорта. Чтобы разубедить Ровена, Гиллиам стал настаивать на сложных декорациях с двумя кранами один на другом и морем припаркованных автомобилей в надежде, что тот решит, что это обойдётся в кругленькую сумму и откажется от этой идеи. Равен, однако, идею одобрил, а Гиллиаму получившийся результат так понравился, что его он и использовал при окончательном монтаже.

Финальную сцену в аэропорту снимали в конгресс-центре Филадельфии, однако сцену, где в здание аэропорта заходят Коул и доктор Рэйли, сняли в аэропорту Балтимора, штат Мэриленд.