Вначале предполагалось изменить форму лба Джадзии Дакс так, как представители цивилизации триллов были впервые показаны в эпизоде «Носитель» сериала «Звёздный путь: Следующее поколение» (1987-1994), премьера которого состоялась 13 мая 1991 года. Во время кинопроб было решено, однако, что исполнительница этой роли Терри Фаррелл слишком хороша, чтобы портить ей лицо специальными накладками. Вместо этого на края лба её нанесли гримом пятнышки. Этим занимался лично специалист по гриму Майкл Уэстмор. Процесс наложения грима занимал более часа. Известно, что Уэстмор «подписывал» свою работу — делая одно пятнышко в форме буквы «М», а другое — буквы «У». С тех пор всех триллов гримировали именно таким образом и без накладок, с которыми их показали в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение». Разницу в облике представителей этой инопланетной расы зрителям нигде не объяснили.

На создание персонажа по имени Элим Гарак, бывшего агента-нелегала инопланетной спецслужбы, переквалифицировавшегося в портного, авторов сериала вдохновило творчество писателя Джона ле Карре и в особенности его роман «Шпион, выйди вон!» (1974).

Задействованные в сериале актёры Александр Сиддиг и Нана Визитор поженились после 5-го сезона и прожили в браке с 1997 по 2001 год.

Для персонажей сериала была придумана униформа, отличающаяся от той, что актёры носили в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение» (1987-1994), серого цвета с цветной верхней частью. Начиная с выхода фильма «Звёздный путь 7: Поколения» (Дэвид Карсон, 1994), эта новая форма распространилась на персонажей сериала «Звёздный путь: Следующее поколение» и на весь Звёздный флот. Во второй половине 5-го сезона сериала «Звёздный путь: Дальний космос 9» персоналу Звёздного флота была предписана форма нового образца (цветная с серой верхней частью), однако актёры сериала «Звездный путь: Вояджер» (1995-2001) продолжали носить старую форму. Стоит также отметить, что форма в сериале «Звездный путь: Дальний космос 9» очень напоминает форму кадетов Звёздного флота в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение», особенно в эпизоде «Первостепенный долг», премьера которого состоялась 30 марта 1992 года.

Роль Джадзии Дакс вначале предложили Фамке Янссен. Именно её грим в эпизоде «Идеальная пара» (1992) сериала «Звёздный путь: Следующее поколение» вдохновил авторов сериала «Звёздный путь: Дальний космос 9» использовать в случае с представителями расы триллов грим, а не изменяющие форму головы накладки. Янссен от роли отказалась, предпочтя сериалу работу в художественных фильмах.

В сериале «Звёздный путь: Дальний космос 9» задействовано больше персонажей второго плана, чем в любом другом сериале франшизы.

После того как на роль капитана Бенджамина Сиско утвердили актёра Эйвери Брукса, продюсеры перестали обращать внимание на цвет кожи актёра, играющего его сына Джейка.

В сериалах «Звёздный путь: Следующее поколение» (1987-1994) и «Звёздный путь: Дальний космос 9» (1993-1999) роль Кейко О'Брайен сыграла актриса Розалинд Чао.

На роль метаморфа Одо собирались пригласить Роберта Патрика, однако было решено, что в этой роли он будет слишком уж напоминать зрителям терминатора из фильма «Терминатор 2: Судный день» (Джеймс Кэмерон, 1991).

Одним из последних кандидатов на роль капитана Сиско, отвергнутых авторами сериала, был актёр Гари Грэхэм, известный участием в телесериале «Чужая нация» (1989-1990). Впоследствии Грэм сыграет вулканского посла Совала в сериале «Звёздный путь: Энтерпрайз» (Рик Берман и Брэннон Брага, 2001-2005).

Вот как сыгравший метаморфа Одо актёр Рене Обержонуа охарактеризовал своего героя: «Это что-то вроде нового шерифа в городке в исполнении ещё молодого Джона Уэйна».

«Космический торговый центр» было рабочим названием сериала. Его изменили на «Звёздный путь: Дальний космос 9» только по завершении съёмок первых трёх эпизодов. Тогда же по экрану пустили бегущую строку с пояснением.

Действие сериала разворачивается в период между 2369 и 2375 годами.

Эйвери Брукс сообщил в одном из интервью в апреле 2003 года, что вначале по контракту от него требовалось отрастить волосы, чтобы отличаться от персонажа в сериале «Спенсер» (1985-1988), которого он играл прежде. Впоследствии, когда актёра уже стали прочно ассоциировать с ролью капитана Бенджамина Сиско, Бруксу позволили снова побрить голову и отрастить бороду.

Персонаж по имени Кира Нерис включили в сюжет в самый последний момент. Изначально авторы сериала рассчитывали использовать Ро Ларен, персонаж из сериала «Звездный путь: Следующее поколение» (1987-1994), однако получили отказ от исполнительницы этой роли Мишель Форбс.

Вначале предполагалось сделать Джадзию Дакс представителем расы с планеты с небольшой силой тяжести, чтобы она передвигалась по станции «Глубокий космос 9» на кресле-каталке, а по своей каюте летала. Эту концепцию пришлось отбросить, потому что тросы, с помощью которых героиня летала бы по своей каюте, были видны в кадре, несмотря на все ухищрения специалистов по спецэффектам. Идею использовали по мере возможности только в эпизоде «Мелора» 2-го сезона, премьера которого состоялась 31 октября 1993 года.

Считалось, что, как и в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение» (1987-1994), персонаж по имени Кью в сериале «Звёздный путь: Дальний космос 9» (1993-1999) будет появляться на более или менее регулярной основе, однако зрители увидели его только в эпизоде «Неизлечимый» (его премьера состоялась 7 февраля 1993 года). Вместо этого Кью появился во многих эпизодах сериала «Звёздный путь: Вояджер» (1995-2001). Продюсеры заявили, что Вупи Голдберг сыграет в одном-двух эпизодах в роли Гайнэн, которую она играла в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение». Было также объявлено, что в роли Спока снимется Леонард Нимой. Сбыться этим планам было не суждено. Так или иначе, в сериале «Звёздный путь: Дальний космос 9» появились персонажи второго плана из сериала «Звёздный путь: Следующее поколение», а именно Вэш в исполнении актрисы Дженнифер Хетрик, Луаксана Трой в исполнении актрисы Маджел Бэррет и сёстры Дюрас, которых сыграли Барбара Марч и Гвинит Уолш.

На роль капитана Бенджамина Сиско пробовались актёры Карл Уэзерс и Эрик Ла Салль. Авторы сериала предлагали её Джеймсу Эрлу Джонсу и Тони Тодду, однако те предложение сыграть Сиско отклонили. Тодд впервые появился в роли Кёрна, младшего брата Ворфа, в сериале «Звёздный путь: Следующее поколение» (1987-1994). В сериале «Звёздный путь: Дальний космос 9» (1993-1999) он сыграл в двух эпизодах 4-го сезона — в эпизоде «Посетитель» (1995) роль постаревшего Джейка Сиско и роль Кёрна в эпизоде «Сыновья Мога» (1996).

Вечно сидящий в баре «У Кварка» персонаж по имени Морн был включён в сериал как дань уважения авторов Норму Петерсону в исполнении Джорджа Уэндта — персонажу ситкома «Чирс» (1982-1993). «Морн» является анаграммой имени «Норм».

Единственный сериал франшизы «Звёздный путь», где среди основных персонажей нет ни одной землянки (Кира Нерис — представительница планеты Баджор, Джазия Дакс представляет цивилизацию триллов). Кэсиди Йейтс и Кейко О'Брайен — единственные периодически появляющиеся в сериале землянки, но это персонажи второго плана.

В эпизоде «Испытание триблами» 5-го сезона сериала «Звёздный путь: Дальний космос 9» речь идёт о перемещениях во времени. Сюжет был написан в ознаменование 30-летней годовщины франшизы «Звёздный путь». Привлечение Уильяма Шетнера, Леонарда Нимоя и других актёров оригинального сериала было невозможно по возрастным соображениям. Вместо этого при помощи технологии «хромакей» персонажей сериала «Звёздный путь: Дальний космос 9» совместили с персонажами эпизода «Проблема с триблами» (1967) оригинального сериала в интерьере звёздолёта «Энтерпрайз». Капитан Сиско с товарищами попали в прошлое, где им предстояло помешать убийце-клингону, который вознамерился убить капитана Кирка и изменить будущее.

Терри Фаррелл рассказала в одном из интервью, что её самым любимым эпизодом во всем сериале является эпизод «Кровная клятва» (1994) 2-го сезона, потому что именно её персонаж стоит там в центре повествования.

Ненависть Сиско к капитану Жану-Люку Пикару носит личный характер. Сиско винит Пикара в смерти его жены Дженнифер в космической битве возле звезды Вульф 359, когда борги использовали знания и навыки ассимилированного Пикара для нанесения сокрушительного удара по Звёздному флоту.

В фильме «Звёздный путь 6: Неоткрытая страна» (Николас Мейер, 1991) Рене Обержонуа снялся в роли полковника Уэста, одного из заговорщиков, осуществивших убийство клингонского канцлера Горкона.

Некоторых поклонников франшизы смутил характер взаимоотношений между Джадзией Дакс и Керсоном Даксом, а когда Сиско назвал Джадзию «стариком», кое-кто ошибочно предположил, будто Джадзия и Керсон — одно и то же лицо. Между тем, в сериале уже объяснялось, что в телах триллов присутствуют некие «симбионты», которые передаются от трилла к триллу в момент смерти. Когда Керсона Дакса не стало, его «симбионт» перешёл в тело Джадзии, а вместе с ним передались и все воспоминания умершего. Таким образом, Джадзия не является Керсоном, но какая-то частица его продолжает в ней жить. Джадзии было 28 лет, когда она стала носителем его «симбионта», а Керсону, когда его не стало, было свыше 100 лет.

В сериале «Звёздный путь: Дальний космос 9» периодически появляется Скотт Барри в роли безымянного баджоранца. То, что его зовут Нала Бал, становится известно только из официальной настольной игры «Звёздный путь» компании «Decipher Inc.»

В первых трёх сезонах сериала «Звёздный путь: Дальний космос 9» Кевин Гревье играет безымянного офицера службы безопасности. О том, что его зовут Тэйлор Мур, становится известно только из официальной настольной игры «Звёздный путь» компании Decipher Inc.

Терри Фаррелл оставила проект по истечении контракта. Авторы сериала решили, что за продление контракта на ещё один сезон актриса потребовала слишком многое. Фаррелл потом заявляла, что с удовольствием появилась бы в 7-м сезоне несколько раз в эпизодах, однако с приближением окончания контракта в конце 6-го сезона её персонаж погибла.

Терри Фаррелл стала единственным актёром основного состава во всех элементах франшизы «Звёздный путь», чей персонаж после гибели ни разу не появился на экране. Спок Леонарда Нимоя был воскрешён, Таша Яр актрисы Дениз Кросби появлялась во флэшбэках и альтернативных вселенных. Кроме того, актриса сыграла повзрослевшую дочь Таши Яр.

Воинские звания во франшизе «Звёздный путь» соответствуют реально существующим. Звания в Звёздном флоте соответствуют званиям Королевского ВМФ Великобритании (приведены российские соответствия): курсант, лейтенант, капитан-лейтенант, капитаны 3-го, 2-го и 1-го рангов, коммодор (в российских званиях соответствующего нет), контр-адмирал, вице-адмирал, адмирал. Баджоранские звания соответствуют званиям армии, ВВС и Корпуса морской пехоты США: лейтенант, майор, подполковник (у баджоранцев — полевой полковник), полковник, генерал. (Киру после повышения называли просто «полковник», но повысили её сразу на два звания.) Звания клингонов: бекк (специалист рядового и старшинского состава), курсант, лейтенант, капитаны 3-го, 2-го и 1-го рангов, полковник, бригадный генерал, генерал, адмирал. Звания кардассиан основаны на воинских званиях Древнего Рима и соответствуют званиям, принятым в Звёздном флоте и ВМФ США: лейтенант, капитан 2-го ранга, капитан 1-го ранга и адмирал.